遼寧省人民醫院微生物室做的一項調查發現：家庭使用2年的木質筷子含菌落數為每平方厘米16.3個，超過了臨床規定的用品表面細菌群落數合格值；使用近2個月的金屬筷子，所含菌落數僅為每平方厘米0.7個。
筷子清洗不徹底時，大腸桿菌、金黃色葡萄球菌、幽門螺桿菌等致病菌，可借由筷子傳播，造成感染患病。特別是使用較久、已有溝壑劃痕的竹木筷子，在略潮濕的狀態下，更易造成細菌繁殖。
在合適的環境下，細菌繁殖速度大約是20分鐘增加1倍，因此餐具使用后必須盡快清洗徹底，以免在人體免疫力降低時引發腸道系統感染。
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